因为流感病毒变异很快，几乎每年都要发生改变，且不同变异株所诱导的抗体对不同毒株无交叉保护作用或交叉保护弱。世界卫生组织（WHO）紧密追踪流感病毒变异的情况，每年定期公布用于疫苗制造的毒株。流感疫苗含有三种毒株，每年流感病毒流行株发生变异了，对应的流感疫苗的毒株配方也随之变化，所以每年都需要接种最新的流感疫苗才能达到预防的效果。